Il y a très longtemps une longue et terrible guerre faisait rage. Lorsque cette dernière prit fin, un pacte de paix fut scellé par les peuples du monde. Celui-ci fut divisé en 7 royaumes et la paix régna pendant plus de 1000 ans.
Un jour Lazarel et Teresa, des cousins et compagnons d'armes, se sont réunis au royaume de Nautys très loin de Dunis, leur foyer. Ils soupçonnent que l'armée de leur pays va envahir Nautys et ainsi briser le pacte de paix.
Avec leur vieil ami César, ils rejoindront le royaume central d'Accordia pour parler à son souverain. Vous devrez alors parcourir le monde afin de restaurer la paix au sein des sept royaumes, vous aurez l'occasion de croiser la route d'êtres venus d'autres mondes qui vous aideront dans votre périple.
À l’instar de son prédécesseur, ce jeu est lui aussi un Musō. Un genre de jeu dans lequel vous devez affronter des hordes d’ennemis en parcourant des zones plus ou moins grandes. Des objectifs supplémentaires peuvent également être présents dans certaines zones et les accomplir vous permet d’accéder aux zones suivantes.
Cet épisode reprend en grande partie ce qui avait été mis en place dans le premier épisode. Néanmoins, la grande nouveauté de cette suite est la présence du système de vocations présent notamment dans certains des épisodes principaux de la franchise. Seuls les 2 personnages principaux pourront bénéficier de ce système.
De nouveaux personnages issus des épisodes principaux font leur apparition dans cette suite comme Raph et Maribel de Dragon Quest VII ou encore Angelo de Dragon Quest VIII.
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